Racoon City. Après la fuite du Virus T dans les laboratoires de la puissante Umbrella Corp., la contamination s'est propagée de manière exponentielle à toute la population de la ville. Les personnes non infectées s'entassent aux sorties de la ville qui a été mise en quarantaine par Umbrella Corp. Pendant ce temps, Alice se réveille dans un laboratoire et ne tarde pas à sortir à l'extérieur. Elle rejoint bientôt un petit groupe de survivants dans une église: deux membres du S.T.A.R.S., Jill Valentine et Peyton Wells, ainsi qu'une journaliste, Terri Morales ...