Après avoir résolu un problème mathématique vieux de plusieurs milliers d'années, écrit dans une autre langue et caché dans un jeu vidéo, le jeune Eli Wallace (David Blue) est appelé à contribuer au projet « Porte des étoiles », en collaborant avec le professeur Nicolas Rush (Robert Carlyle) sur la base Icare, où se trouve l'énergie nécessaire à l'utilisation du neuvième chevron ; énergie provenant du coeur de la planète sur laquelle la base est installée.
Devant la station météo de Wick en Ecosse, la mer se déchaîne... Soudain une vague gigantesque emporte la station au fond de l'eau ! Un peu plus loin, c'est une femme et sa mère qui se retrouvent piégées à l'intérieur de leur maison... C'est bientôt Londres qui se trouve menacée par une inondation qui s'annonce catastrophique...