San Fransisco, 1868. Le professeur Arronax et son fidèle Conseil sont bloqués à San Fransisco. Les marins refusent d'embarquer car depuis quelques semaines plusieurs bateaux ont été coulés par un monstre marin, selon les témoignages de quelques rescapés. Ils décident alors de participer à la mission d'enquête de l'armée américaine qui appareille un navire de guerre afin d'élucider les mystérieuses disparitions et éventuellement tuer le monstre. Ils sont aidés par la harponneur Ned Land. Après plusieurs mois de recherches infructueuses, il décide d'abandonner les recherches. Soudain, un vaisseau qui croise près d'eux et attaqué et coule. Ils prennent le monstre en chasse, mais celui-ci fonce sur eux et éperonne le navire de guerre : Arronax, Conseil et Ned Land sont jetés à l'eau...