Les années ont passé. Fin et April élèvent leur dernier né. Ils se croient à l'abri des requins, mais une nouvelle tornade de squales apparaît à Las Vegas. Fin reprent en main sa tronçonneuse pour tenter d'empêcher l'invasion de requins tueurs.
Après avoir fait des ravages à Los Angeles et New York, une tornade de requins s'abat cette fois sur la capitale des Etats-Unis : Washington D.C., juste au moment où Fin se rend à la Maison Blanche.
La Sharknado détruit tout sur son passage, jusqu'aux côtes de Floride où April, enceinte de neuf mois, attend impatiemment Fin. Il tente de rejoindre sa famille au plus vite mais des centaines de tornades de requins font leur apparition pour finir par former une tornade géante qui menace de détruire toute la côte Est. Fin réalise alors qu'il va devoir trouver une solution, qui ne se trouve peut-être pas sur Terre...
Un jeune talent de breakdancer se cogne la tête lors d'une prestation et tombe dans le coma. Il se réveille vingt ans plus tard en 2006 et va s'efforcer de reconstituer son équipe. Mais le monde à bien changé depuis les années 80...