L'histoire se déroule en 2415. En 2011, un virus mortel a éliminé 99 % de la population de la Terre et, depuis lors, les survivants de l'espèce humaine habitent à Bregna, une cité-État murée dirigée par un congrès de scientifiques. Æon Flux (Charlize Theron) est un assassin, membre d'une organisation rebelle clandestine menée par The Handler : les Monicans. Ceux-ci communiquent par télépathie en utilisant des pilules.
Après une mission pour détruire une station de surveillance, Æon revient chez elle et y retrouve le corps sans vie de sa s?ur Una, tuée pour avoir été suspectée d'être une rebelle Monican.
Quand Æon est envoyée pour tuer le chef du gouvernement, Trevor Goodchild (Marton Csokas), elle découvre qu'elle joue inconsciemment un rôle dans un coup d'État secret. Cette découverte l'amène à s'interroger sur l'origine et le destin de chacun dans Bregna, en particulier sur sa relation personnelle avec l'homme qu'elle est chargée d'assassiner. C'est alors qu'elle apprend qu'elle est un clone de Cathryn, la défunte épouse de Goodchild, mais aussi que celui-ci mène des expériences en secret afin de trouver un remède à la stérilité qui affecte la population depuis l'éradication du virus.
En effet, chaque nouveau-né à Bregna est en fait un clone créé avec de l'ADN recyclé ; les morts renaissent donc en conservant des fragments de leur mémoire. Une des expériences de Trevor finit par réussir mais son frère, Oren Goodchild (Jonny Lee Miller), fait cesser ses recherches afin de rester au pouvoir et de vivre éternellement. Cependant, lors d'une confrontation avec Trevor et Æon, Oren laisse entendre que l'humanité elle-même s'est adaptée et que certains individus ont recouvré la capacité d'avoir des bébés.
Æon se voit donc forcée d'agir contre les plans des Monicans, qu'elle parvient finalement à convaincre de ne pas écouter leur chef et de s'allier à elle pour tuer Oren et ses hommes.
Dans la scène finale, lorsqu'Æon se prépare à détruire l'entrepôt-dirigeable où l'ADN utilisé pour le clonage est stocké, elle rencontre le vieil homme chargé de surveiller l'ADN. Il s'agit en fait du docteur qui a préservé son ADN lorsqu'Oren avait commandé sa destruction. Le crash du dirigeable détruit le mur entourant la ville et, pour la première fois depuis des siècles, la population peut enfin gagner le monde extérieur.
Le film incorpore de nombreux éléments des épisodes de la série télévisée, spécialement de l'épisode A Last Time For Everything, tout comme le roman graphique basé sur la série : Æon Flux: The Herodotus File.
Jack Shepard, un super-héros à la retraite dont les aventures étaient contées dans des bandes dessinées, doit reprendre du service pour l'armée et entraîner un quatuor de jeunes avec des pouvoirs exceptionnels pour les transformer en véritables super-héros et les préparer, sans le savoir, à affronter Conor Shepard, son frère qui a autrefois détruit l'équipe qu'il formait avec d'autres super-héros, maintenant morts. Mais avant, il devra gagner la confiance de ces jeunes en commençant par regagner sa confiance en lui-même.
En 1975, Jean Grey provoque un accident de voiture qui tue sa mère et blesse son père. Terrorisée et orpheline, la fillette est recueillie par le Professeur Xavier, qui lui présente son Institut.
1992. Neuf ans après les événements liés à l'attaque d'Apocalypse1, les X-Men sont devenus des héros. Charles Xavier envoie son équipe sur des missions de plus en plus dangereuses. À la demande du Président des États-Unis, ils sont envoyés dans l'espace, à la rescousse des passagers de la navette Endeavour, apparemment prise dans une éruption solaire. Jean est presque tuée lorsqu’elle est frappée par une mystérieuse force cosmique. Une fois rentrée chez elle, cette force la rend non seulement infiniment plus puissante, mais aussi beaucoup plus instable. En lutte avec cette entité en elle, Jean libère ses pouvoirs d’une manière qu’elle ne peut ni comprendre ni contenir. Alors que Jean devient incontrôlable et fait du mal à ceux qu’elle aime le plus, elle commence à démêler le tissu même qui unit les X-Men.
Maintenant, avec cette famille en train de s’effondrer, les X-Men doivent trouver un moyen de s’unir non seulement pour sauver l’âme de leur amie Jean, mais aussi pour sauver la Terre des extraterrestres qui souhaitent s’armer de cette force et gouverner la galaxie2.
En 2023, les mutants ainsi que des humains susceptibles d'engendrer des mutants, et d'autres humains qui voulaient aider les mutants, ont été presque exterminés au cours d'une guerre contre les Sentinelles, des robots conçus pour trouver et éliminer les mutants. Dans un ultime effort pour changer le cours tragique des événements, le professeur Charles Xavier et Magnéto renvoient l'esprit de Wolverine dans son propre corps, en 1973, grâce aux talents de Kitty Pride. Ainsi conscient de l'avenir qui se prépare, il doit y retrouver les jeunes mutants écorchés qu'ils ont été.
Logan y retrouve un Charles Xavier qui a renoncé à ses pouvoirs, et qui vit cloîtré avec Hank dans son manoir. Charles annonce à Logan que Magnéto est emprisonné dans le Pentagone pour l'assassinat de John F. Kennedy. Le but de Wolverine est de convaincre Xavier et Magnéto que la guerre va éclater à la suite d'un enchaînement d'évènements provoqués par Mystique : elle cherche à abattre le docteur Bolivar Trask qui est en train de mettre au point les Sentinelles. Une fois qu'elle aura tué Trask, elle sera immédiatement arrêtée, et l'utilisation de ses cellules de mutante permettra de faire des Sentinelles ces armes absolues dans le futur : ses facultés de métamorphe seront synthétisées et données aux Sentinelles, leur permettant de s'adapter aux pouvoirs de leurs adversaires.
Comme ils ont besoin de Magnéto pour convaincre Mystique de renoncer à son meurtre, Xavier, Hank et Logan décident de le faire évader du Pentagone. Pour ce faire, ils sollicitent l'aide de Vif-Argent, qui accepte de les aider. Grâce à lui, ils se débarrassent aisément des gardes et font sortir Magnéto, puis s'envolent pour Paris. Pendant le trajet, Xavier et Erik se disent ce qu'ils ont sur le c?ur et semblent entamer leur réconciliation.
Cependant, lors de la Conférence de Paris pour la fin de la guerre au Viêt Nam, Magnéto décide purement et simplement d'éliminer Mystique pour la survie des mutants. Il la blesse à la jambe, et son sang est ensuite récupéré par l'équipe du docteur Trask. Comme ils se sont battus aux yeux du monde entier, le président des États-Unis Richard Nixon décide de valider le programme Sentinelle de Trask, qui sont assemblées et présentées au public.
Magnéto se sert alors des prototypes des Sentinelles pour faire comprendre aux humains et aux mutants le potentiel de ces nouveaux robots. Il déplace le Robert F. Kennedy Memorial Stadium de Washington pour isoler la Maison-Blanche, et se présente aux caméras du monde devant le président Nixon et son état-major désarmé. Logan, le Fauve et Xavier tentent de s'interposer mais sont mis en déroute par les Sentinelles, sous le contrôle de Magnéto. Mystique, prend l'apparence du président pour empêcher Magnéto de le tuer. Elle y parvient et renonce finalement à tuer Trask grâce à Xavier, ce qui fait d'elle une héroïne aux yeux des humains.
Dans le monde futur, les Sentinelles débusquent les mutants cachés dans un temple en Chine. Un combat s'engage alors, et Iceberg, Bishop, Tornade, Solar, Colossus et Blink sont tués. Xavier, Magnéto, Kitty et Wolverine se retrouvent à la merci des Sentinelles qui s'apprêtent à les consumer mais comme, cinquante ans plus tôt, Mystique a renoncé à son projet d'assassinat, le futur apocalyptique est effacé de la ligne temporelle.
Logan reprend ses esprits dans l'école de Xavier où les cinquante dernières années écoulées n'ont rien à voir avec la vie qu'il a connue. Les mutants vivent en harmonie avec les humains, et tous les X-Men sont vivants, y compris Scott et Jean Grey. Bobby et Malicia sont toujours ensemble, et Kitty est devenu professeur.
Dans la scène post-générique, une foule dans le désert acclame un adolescent en train de construire une pyramide avec ses pouvoirs, observé par quatre cavaliers. Ils scandent son nom : En Sabah Nur. Il s'agit en fait d'Apocalypse, antagoniste central du prochain épisode cinématographique des X-Men.
3600 ans plus tôt en Ancienne Égypte, des milliers de personnes saluent avec dévotion un cortège royal et clament un nom, En Sabah Nur, alias Apocalypse, tandis que de mystérieux gardes se regardent avec insistance. La troupe est constituée d'Apocalypse, vieux et fatigué, et de ses Quatre Cavaliers, tous des mutants dont il a fait évoluer les pouvoirs. Ceux-ci et d'autres personnes entrent dans une immense pyramide pour procéder à un rituel, au cours duquel Apocalypse va transférer son esprit dans le corps d'un mutant capable de guérir de toutes les blessures physiques, afin de s'emparer de ses pouvoirs et de retrouver sa propre jeunesse. Mais alors que le transfert commence, les gardes se mutinent et tentent d'assassiner le mutant, le traitant de faux dieu. Les Cavaliers tombent les uns après les autres en protégeant leur maître, tandis que la pyramide est détruite par les mutins. Avant de mourir, la Cavalière de la Mort a le temps d'enfermer le nouveau corps de son maître dans un cocon télékinétique.
Des milliers d'années plus tard, en 1983, dans une salle de classe de l'Ohio, une enseignante projette des photographies au tableau et parle des mutants à ses élèves. Elle présente tour à tour Magnéto, un mutant qui a défié le monde et failli le détruire il y a 10 ans, et Mystique, une héroïne qui l'a défendu. Dans cette salle de classe, un des étudiants, Scott Summers, se plaint de douleurs qu'il ressent au niveau des yeux et demande à sortir. Caché ensuite dans les toilettes, il projette alors un puissant rayon d'énergie qui provoque des dégâts terribles. Au même moment, à Berlin-Est, en Allemagne, Raven Darkholme, Mystique assiste à un combat clandestin entre deux mutants, Warren Worthington III, qui n'est d'autre qu'Angel, et Kurt Wagner, alias Diablo, capable de se téléporter. Ce dernier est sauvé par Raven, qu'il reconnait comme la grande sauveuse de la cause mutante et décide de l'accompagner. En Pologne, Erik Lehnsherr, alias Magnéto, a refait sa vie sous la fausse identité d'Henrik Gurzsky et vit désormais sur la terre de ces ancêtres. Marié avec Magda et père d'une petite fille, Nina, il travaille maintenant dans une fonderie et semble avoir oublié ses vieux démons.
Alex Summers, frère ainé de Scott, alias Havok, décide de l'emmener à l'École pour Jeunes Surdoués du professeur Xavier, où il le présente à Charles et Hank. C'est à cette occasion que Scott, devenu Cyclope, rencontre Jean Grey, alias Marvel Girl, une mutante aux pouvoirs psychiques prodigieux, et démontre lui-même ses pouvoirs en coupant en deux le chêne préféré de Charles. Au même instant, en Égypte, Moira MacTaggert assiste en secret, dans une grotte souterraine, à ce qui semble être une cérémonie ésotérique dans laquelle des hommes appellent à eux Apocalypse. Leurs incantations et le Soleil passant par l'entrée de la grotte, laissée ouverte par Moira, auront pour conséquence le réveil d'Apocalypse, ce qui provoque une vague sismique à travers le monde, que ce soit en Égypte, aux États-Unis ou en Pologne. Jean ressent la force d'Apocalypse dans son sommeil et perd le contrôle de son pouvoir, avant que Charles n'intervienne pour la réveiller. Celle-ci partage avec lui les images qu'elle a vu en rêves et lui annonce qu'elle a vu la fin du monde. En Pologne, Erik sauve un homme dans l'usine grâce à ses pouvoirs, mais terrifié que quelqu'un ait pu remarquer quoi que ce soit, il demande à sa femme de fuir à ses côtés. Ils se rendent compte alors que leur fille n'est pas dans la maison et partent à sa recherche dans la forêt. Ils la retrouvent enfin avec des gendarmes du village qui, à cause des collègues de travail d'Erik, l'ont reconnu comme étant Magnéto, le mutant destructeur présumé. Il décide alors de se laisser arrêter, afin de sauver sa femme et sa fille. Mais Nina, prenant la capture de son père très à c?ur, déchaîne alors son pouvoir, celui de contrôler les animaux. Dans la confusion, un des gendarmes tire une flèche sur la jeune mutante, la tuant d'un seul coup avec sa mère. Horrifié par ce qui arrive, et désespéré face à la fatalité qui l'accable, il tue alors tous les gendarmes avant de fuir. Rapidement, la nouvelle de la réapparition de Magnéto fait le tour du globe et un mandat d'arrêt international est lancé contre lui. Aux États-Unis, Peter Maximoff, alias Vif-Argent, regarde la télévision et y voit les derniers événements concernant Magnéto. Sa mère l'exhorte alors à rendre visite au Professeur Xavier.
En Allemagne, Mystique emmène Kurt chez un trafiquant d'identités, Caliban, afin qu'il l'aide, contre rétribution, à obtenir un passeport réglementaire et des faux papiers pour se rendre là où il le souhaite. C'est à cette occasion que Caliban lui apprend les derniers actes commis par Magnéto et que cette dernière décide d'emmener finalement le jeune homme chez Charles.
De son coté, Charles utilise Cerebro pour observer l'épicentre du phénomène, et y retrouve Moira MacTaggert à l'endroit même de la première secousse. Ce qui fait remonter à la surface un certain nombre de souvenirs. Il décide alors de lui rendre visite à son retour avec Alex, mais celle-ci ne se souvient pas d'eux, ni d'avoir combattu à leurs cotés, ni d'aucun des événements de la Baie des Cochons, car Charles lui avait effacé la mémoire peu après afin qu'elle ne se souvienne pas de l'existence des mutants. Celle-ci, toutefois, le connait de nom et a lu tous ses travaux sur la Mutation, desquels elle s'est servie pour l'enquête en cours. Elle leur explique alors l'existence d'une secte d'adorateurs qui tentent de retrouver le premier de tous les mutants, En Sabah Nur, et le danger potentiel que celui-ci représenterait. Celui-ci, selon elle, était toujours accompagné de quatre mutants parmi les plus puissants du monde, dont il rendait les pouvoirs beaucoup plus puissants.
Au manoir, Hank donne des lunettes en quartz-rubis à Scott pour réfracter son rayon d'énergie et lui permettre de voir sans blesser quelqu'un. C'est là qu'il rencontre officiellement Jean Grey, et parle avec elle, se trouvant tous les deux, de nombreux points communs.
En Égypte, En Sabah Nur s'est libéré de sa prison millénaire et arpente les rues du Caire, découvrant la nouvelle civilisation. Au même moment, une jeune mutante, Ororo Munroe, qui se fera plus tard connaître sous le nom de Tornade, à la tête d'une bande de gamins des rues, utilise ses pouvoirs pour créer une légère bourrasque et tente de voler quelque chose. Mais elle se fait rattraper par les vendeurs qui tentent de lui couper la main droite. Elle est alors sauvée par En Sabah Nur, qui neutralise d'un seul coup tous ses assaillants. Elle l'emmène alors chez elle pour le remercier et lui révèle son admiration sans limite pour Mystique. En Sabah Nur, par le biais de la télévision, se connecte à toutes les bases informatiques, apprenant en un seul geste tous les langages de la Terre, toutes les informations sur l'emplacement des armes nucléaires et surtout, l'histoire des mutants. Considérant que les faibles ont pris le pouvoir sur les forts, Apocalypse commence alors sa vendetta en amplifiant les dons naturels de Tornade, provoquant le blanchissement de ses cheveux et sa transformation en Cavalière de la Famine. Ensuite, il se rend chez Caliban où il rencontre Psylocke, sa garde-du-corps, et l'engage comme Cavalière de la Pestilence, lui donnant également des capacités plus grandes. Il se téléporte enfin dans une église où il fait la rencontre d'Angel et le transforme en Cavalier de la Mort, lui donnant une nouvelle paire d'ailes en métal tranchant. Il possède donc trois cavaliers sur les quatre.
Mystique arrive enfin au manoir où elle est accueillie par Hank et tous les deux se remémorent les souvenirs qu'ils ont ensemble. Il lui montre alors son nouveau vaisseau, qu'il a construit pour les X-Men, dans l'espoir que ceux-ci se reformeraient, mais rien ne semble s'être produit. Kurt rencontre alors Scott, Jean et Jubilee qui décident alors de sortir pour voir un film. Charles, de retour au manoir avec Alex et Moira, parle avec Raven, qui lui révèle le problème d'Erik. Charles décide alors de le localiser avec Cérébro, mais lorsqu'il le retrouve, il est déjà trop tard. Il est déjà devenu le Cavalier de la Guerre d'Apocalypse, qui lui a offert alors des pouvoirs encore plus grands. Il n'utilise plus seulement le métal industriel, mais le champ magnétique terrestre, lui donnant des possibilités exponentielles. Charles tente de le raisonner mais rien n'y fait, il est résolu à détruire l'Humanité aux côtés d'En Sabah Nur. Celui-ci profite alors de la connexion entre Erik et Charles pour prendre le contrôle du Cérébro et désarmer l'Humanité entière en lançant tous les missiles nucléaires du monde dans l'espace. Toutefois, Alex, sur la demande de Charles, détruit le Cérébro avec son rayon. Mais en sortant du Cérébro, tous tombent nez-à-nez sur Apocalypse et ses Cavaliers qui enlèvent Charles. Alex tente de les arrêter, malgré les cris de Hank, et envoie son rayon sur la distorsion spatio-temporelle, mais celle-ci se referme avant qu'il ne l'atteigne, il touche alors un des réacteurs du Blackbird, provoquant une terrible explosion qui détruit le manoir. Néanmoins, Vif-Argent, qui se rendait également au manoir, sauve tous ceux qui se trouvaient à l'intérieur. Toutefois, il n'arrive pas à sauver Alex, qui meurt dans l'explosion. Au même moment, alors qu'ils sortent d'une séance du Retour du Jedi, Jean, Scott, Kurt et Jubilee arrivent sur place et constatent avec effarement l'explosion du manoir et la mort d'Alex.
C'est alors que William Stryker apparaît et enlève sous les yeux des étudiants, Hank, Moira, Mystique et Vif-Argent. Jean, grâce à ses pouvoirs, réussit à les rendre elle, Scott et Kurt invisibles pour qu'ils se glissent dans l'hélicoptère qui les emmène à la base d'Alkali Lake. Là, Mystique, Moira, Peter et Hank sont enfermés dans une cage electrifiée. Hank, à court de sérum, reprend sa véritable forme animale bleue, et Peter révèle la vérité à tous : il est en fait le fils de Magnéto, mais celui-ci ne l'a jamais su. Pendant ce temps, au Caire, Charles voit ses pouvoirs amplifiés par Apocalypse et envoie un message au monde, celui de se défendre quoi qu'il arrive contre ce monstre. Il envoie également par télépathie un message secret à Jean pour lui dire l'endroit où il se trouve. Apocalypse dévaste alors le Caire avec ses pouvoirs et construit une nouvelle pyramide en son centre, entièrement faite de métal, puis révèle à Charles qu'il est la pièce maîtresse de son plan, en effet, il compte bien transférer son esprit dans son corps afin de devenir le mutant télépathe parfait et omniprésent. Erik commence alors son propre travail et dérègle le magnétisme terrestre, provoquant des catastrophes naturelles à travers le monde.
De leurs cotés, les jeunes mutants libèrent une créature prisonnière du laboratoire : Wolverine, prisonnier de Stryker depuis dix ans , ayant perdu la mémoire à cause des expérimentations du projet Arme X. Stryker lui a, en effet, recouvert le squelette d'adamantium et celui-ci se déchaîne, supprimant tous les soldats et provoquant la fuite de Stryker. Avant qu'il ne s'enfuie, Jean lui rend une partie de sa mémoire. Ils libèrent ensuite les autres et Jean leur révèle l'emplacement de Charles. Conduits par Mystique, tous prennent un avion de l'armée et se rendent au Caire pour libérer Charles. Alors que le transfert de conscience est sur le point de commencer, Diablo est confronté à son ancien adversaire Angel, Hank est confronté à Psylocke, et Scott à Tornade. De leur côté, Mystique et Vif-Argent se rendent auprès de Magnéto, mais Peter n'arrive pas à révéler la vérité à son père. Malgré cela, Mystique réussit à insérer le doute dans son esprit, en lui disant qu'elle protégerait ce monde, même au prix de sa vie. Après un combat rapproché terrible, Diablo réussit à se débarrasser d'Angel et réussit à téléporter Charles et tous les autres, sauf Peter et Mystique, dans l'avion. Dans leur tentative de décoller, ils sont attaqués par Psylocke et Angel, mais Jean demande à ce moment-là à Kurt de les téléporter tous hors de l'avion. Après plusieurs tentatives, celui-ci réussi à les téléporter un peu plus loin dans la ville, mais il s'évanouit, complètement vidé de son énergie. L'avion s'écrase provoquant la mort possible d'Angel et la chute de Psylocke.
Enragé d'avoir perdu Charles, Apocalypse essaye de le retrouver, quand il se fait attaquer par Vif-Argent, mais celui-ci, ne faisant pas le poids, est immobilisé, et Apocalypse intime l'ordre à Psylocke de l'achever. Il s'agit en réalité de Mystique qui tente de tuer Apocalypse mais il survit et commence à l'étrangler sous les yeux de Tornade. Elle est alors sauvée in extremis par l'intervention de Magnéto qui a décidé de prendre aux mots Mystique. Quand Apocalypse dit Toi tu me trahis ? Erik répond simplement Non, c'est eux que j'ai trahi et utilise ses pouvoirs contre Apocalypse. Il est rejoint dans son combat par Hank et Scott, mais cela ne suffit pas. Charles, épuisé et devenu chauve des suites de la tentative de transfert, tente d'utiliser le lien que tous les deux partagent dans le but de le détruire, mais il est pris à son propre piège, et son esprit est sur le point d'être oblitéré. Quand soudain, il demande à Jean de l'aider et de libérer ses véritables pouvoirs. Après quelques moments d'hésitation, cette dernière s'exécute, et utilise la puissance du Phénix pour détruire littéralement le corps et l'esprit d'Apocalypse, immobilisé par les pouvoirs combinés de Magnéto, de Scott et de Tornade, qui a également décidé de rejoindre les X-Men. Avant de mourir cependant, Apocalypse semble entrevoir l'avenir et s'exclame que tout lui a été révélé. Après la mort d'Apocalypse, Psylocke quitte le champ de bataille.
Moira, aux côtés de Charles, lui demande s'il va bien et s'il sait où il se trouve. Celui-ci lui répond qu'il est sur une plage, en référence à l'épisode de Cuba et décide de lui rendre ses souvenirs. Le monde entier apprend de Moira que ce sont des mutants, menés par Charles Xavier, Mystique mais aussi à la grande surprise de tous, par Magnéto, qui ont sauvé le monde du chaos. Grâce à Magnéto et Jean, le manoir est rebâti. Vif-Argent et Tornade décident de rejoindre l'équipe. Celle-ci lui demande s'il compte un jour raconter à son père la vérité, ce à quoi Peter répond qu'il le fera, en temps voulu. Plus tard, Erik quitte son vieil ami Charles, considérant que sa place n'est pas dans ce manoir.
La scène de fin montre Mystique, qui a enfin accepté sa véritable forme et rejoint ses amis, en train d'entraîner, avec des Sentinelles, la nouvelle génération de X-Men, constituée de Cyclope, Marvel Girl, Vif-Argent, Diablo et Tornade. Ils sont pour la plupart dans une tenue assez proche des tenues des comics classiques.
La scène post-générique se passe à Alkali Lake, après le massacre provoqué par Wolverine. Nous voyons une équipe paramilitaire investir la base, avec à sa tête un homme qui récupère une fiole de sang appartenant à Wolverine et la met dans une mallette de la société Essex Corp.
Ce film nous fait découvrir les origines du plus rebelle des héros Marvel et son histoire avant les événements de la trilogie X-Men. Hugh Jackman reprend son rôle fétiche de héros au pouvoir de régénération convoité par l'armée, et impitoyable jusqu'au bout des griffes.
Après avoir intégré le programme militaire « Weapon X » qui transforme Wolverine en arme vivante en ayant recours a une opération qui injecte de l'adamantium liquide dans le corps, Wolverine n'a de cesse de retrouver ceux qui ont tué la femme qu'il a aimée2.
En 1944, dans un camp de concentration allemand en Pologne, le Dr Schmidt découvre les aptitudes d'un jeune enfant juif capturé, Erik Lensherr. Celui-ci a montré une capacité à contrôler les champs magnétiques, lui permettant de manipuler le métal, en déformant un grillage pour libérer sa mère. Afin de le forcer à utiliser ses pouvoirs sur une pièce de monnaie, Schmidt tue la mère d'Erik sous ses yeux, provoquant la colère de l'enfant et la destruction de tous les objets métalliques de la pièce. Au même moment, dans un manoir dans le Comté de Westchester, le jeune télépathe Charles Xavier fait la rencontre de Raven dans sa cuisine ; loin de chasser la métamorphe qui s'est introduite par effraction, il lui propose de l'héberger et de l'aider.
En 1962, Lensherr, devenu adulte, traque les officiers nazis pour retrouver la trace du Dr Schmidt à travers l'Amérique du Sud, alors qu'à Oxford, Charles Xavier soutient sa thèse sur la mutation génétique en présence de Raven, devenu sa s?ur adoptive. Mais à Las Vegas, Moira MacTaggert découvre l'existence des mutants en surprenant la rencontre entre le colonel Hendry et le Club des Damnés, composé de Sebastian Shaw, Emma Frost, Azazel et Riptide. Ceux-ci fomentent un complot dont la première étape consiste à faire en sorte que les États-Unis installent des missiles nucléaires en Turquie. Hendry vient à bout de sa mission, mais quand il défie Shaw, qui se révèle être Schmidt qui a changé d'identité, celui-ci lui montre son pouvoir d'absorption d'énergie avant de le tuer
La société pharmaceutique Worthington a mis au point un « vaccin » permettant aux mutants de renoncer à leurs pouvoirs. Pour la première fois de leur histoire, un choix s'offre à eux : conserver leurs caractéristiques uniques mais également la méfiance de l'humanité, ou bien abandonner leurs pouvoirs et devenir des êtres humains normaux.
Scott Summers (Cyclope) retourne à Alkali Lake, persuadé que Jean Grey n'est pas morte. Retrouvée par Tornade, le professeur Xavier et Wolverine, Jean Grey est bien vivante mais semble changée. Ce sont ses pouvoirs qui la contrôlent ou du moins la partie négative de son subconscient, appelée « le Phénix ». N'ayant plus de repères, le Phénix s'allie à Magnéto et sa confrérie, remontée contre la firme qui produit les vaccins anti-mutants, persuadée par Magnéto que Xavier lui a menti toute sa vie sur ce qu'elle est vraiment.
L'agressivité du Phénix ne faisant que grandir tout au long du film, lors d'une scène particulièrement forte dans la maison d'enfance de Jean Grey, le professeur Xavier, aidé par Magnéto, essaiera de contrôler le Phénix mais cette dernière, rongée par une ranc?ur accumulée durant toutes ces années (le professeur avait mis en place des liens psychiques sur Jean Grey afin de contenir sa force mentale) va libérer sa puissance destructrice et, par là-même, tuera le professeur Xavier.
Magnéto ayant de nouveau le champ libre, lèvera une armée de mutants afin d'assiéger l'île d'Alcatraz, île sur laquelle se trouve l'enfant grâce auquel la société Worthington fabrique les vaccins anti-mutants. Tornade, Wolverine et les autres devront trouver la force pour s'unir et affronter Magnéto. L'affrontement final peut enfin commencer.
Alors que les X-Men sont à la recherche d'un étrange mutant dénommé Kurt Wagner, qui s'est introduit dans le bureau ovale pour tenter d'assassiner le président des États-Unis, l'opinion publique leur est de plus en plus hostile. Le Professeur Xavier et Cyclope rendent visite à Magnéto dans sa prison pour savoir s'il est impliqué et Xavier découvre qu'un certain William Stryker, un militaire qui semble en savoir long sur le passé de Wolverine, a soutiré des informations à Magnéto. Stryker, aidé par son assistante Yuriko Oyama, kidnappe le Professeur Xavier et Cyclope et lance ensuite un raid sur le manoir de la Fondation Xavier. Il s'empare du Cerebro et de la majorité des élèves mutants pendant que Tornade et Jean Grey recherchent et finissent par trouver Diablo (Kurt Wagner), le mutant-terroriste de la Maison Blanche, dont le pouvoir est de se téléporter où il le souhaite. Parmi les rescapés de l'attaque du manoir, on compte Malicia, Pyro, Iceberg, Wolverine et d'autres élèves qui se sont échappés par les différents couloirs de sortie.
Mystique parvient à faire échapper Magnéto de sa prison pendant que Wolverine, Malicia, Iceberg et Pyro se rendent à Boston pour retrouver Jean et Tornade. Ils font une halte chez les parents d'Iceberg mais le frère de ce dernier les dénonce à la police. Les X-Men s'échappent en jet mais sont poursuivis par l'US Air Force et ne doivent leur salut qu'à l'intervention de Magnéto. Les X-Men font alors alliance avec Magnéto et Mystique pour contrer les plans de Stryker, qui contrôle certains mutants en leur injectant une drogue. Jean Grey lit dans l'esprit de Diablo, qui a été lui aussi été sous l'influence de Stryker, et apprend que le militaire a sa base à Alkali Lake. Les mutants se rendent donc à Alkali-Lake où Stryker, grâce à son fils Jason, communément appelé le mutant 143, contrôle les pouvoirs du professeur Xavier et lui commande de tuer tous les mutants de la planète.
Wolverine affronte et tue Yuriko Oyama pendant que Grey libère Cyclope de son contrôle mental, et que Tornade et Diablo libèrent les élèves de l'Institut. Magnéto retrouve à temps Xavier dans la base militaire et inverse les paramètres du Cérébro pour que la cible soit les humains ordinaires. Les X-men parviennent à l'arrêter, mais la base commence peu à peu à s'écrouler à cause des fissures provoquées par Cyclope et Jean Grey lors de leur affrontement. Magnéto et Mystique quittent les lieux et emmènent Pyro, qui s'est rallié à leur cause, avec eux. Suite au début de l'engloutissement de la base d'Alkali-Lake, Jean Grey descend du jet et grâce à ses pouvoirs télékinétiques, fait barrage à l'eau et démarre l'avion, avant d'être engloutie par les flots. Cette hypothétique mort affecte fortement Cyclope et Wolverine. Par la suite, le président des États-Unis obtient grâce aux X-Men la vérité sur les intentions de Stryker et réalise les avantages d'une paix avec les mutants. Mais, à Alkali Lake, l'ombre d'un phénix apparaît dans le lac...
L'évolution de la vie passerait par des périodes de mutation massives. L'humanité vit l'une de ces périodes. Ainsi, plusieurs humains mutants possèdent des pouvoirs prodigieux, ce que craint la population en général. Devant ce fait, certains mutants se divisent en deux groupes. Ceux ayant à leur tête le professeur Charles Xavier, un puissant télépathe qui prône une collaboration avec les humains normaux, et ceux ayant à leur tête Erik Lensherr, plus communément appelé Magnéto, capable de créer de puissants champs magnétiques et prônant une attitude agressive envers les humains normaux, attitude probablement inspirée de son emprisonnement, lors de son enfance, dans un camp d'extermination nazi. Xavier a fondé, au nord de Salem (Massachusetts), un institut qui entraîne de nombreux élèves comme Tornade, Jean Grey et Cyclope. Les membres de cet institut, les X-men, essaient de contrer les actions de Magnéto et de ses acolytes. Une mutante, Malicia, dont les pouvoirs sont apparus à l'adolescence, peut absorber l'énergie vive d'une personne et s'approprier ses pouvoirs de façon temporaire ou définitive s'il s'agit d'un mutant. Faisant de l'auto-stop pour aller, probablement, en Alaska, elle rencontre, au Canada, Wolverine, un mutant aux capacités de regénération exceptionnelles. Ce dernier accepte de l'emmener dans son véhicule. Dent de Sabre, un mutant au service de Magnéto, les attaque, mais Malicia et Wolverine sont sauvés par Cyclope et Tornade. Ramenés à l'institut, Wolverine et le professeur Xavier concluent un pacte pour découvrir les intentions de Magnéto.
Magnéto fait kidnapper le sénateur Robert Kelly, favorable à une loi obligeant les mutants à révéler publiquement leur identité, par ses autres acolytes, Mystique et le Crapaud. Magnéto le soumet à une machine de son invention qui provoque une mutation chez les êtres humains normaux. Malicia est convaincue par Mystique, qui a pris l'apparence de Bobby Drake, qu'elle n'est pas la bienvenue à l'institut et quitte la résidence. Elle est enlevée par Magnéto, Dent de Sabre et le Crapaud malgré les efforts de Wolverine, Cyclope et Tornade pour la secourir.
Kelly s'échappe de sa prison mais, une fois arrivé à l'institut Xavier, sa mutation devient instable et il meurt. Xavier découvre cependant que Magnéto compte utiliser Malicia pour alimenter sa machine et tente de la localiser avec le Cerebro mais cet appareil a été saboté par Mystique et il tombe dans le coma. Jean Grey réussit à utiliser Cerebro et découvre que Malicia est retenue sur Liberty Island, Magneto comptant utiliser sa machine sur les leaders mondiaux réunis sur l'île voisine d'Ellis Island. Les X-Men se rendent donc à la statue de la Liberté et sauvent Malicia de la mort après un combat prolongé contre Magnéto et ses sbires. Après cette périlleuse mission, Wolverine décide de partir pour retrouver son passé et se dirige vers la base militaire de Alkali Lake. Xavier, qui est sorti de son coma, rend visite à Magnéto, désormais emprisonné dans une prison spéciale.
L'évolution de la vie passerait par des périodes de mutation massives. L'humanité vit l'une de ces périodes. Ainsi, plusieurs humains mutants possèdent des pouvoirs prodigieux, ce que craint la population en général. Devant ce fait, certains mutants se divisent en deux groupes. Ceux ayant à leur tête le professeur Charles Xavier, un puissant télépathe qui prône une collaboration avec les humains normaux, et ceux ayant à leur tête Erik Lensherr, plus communément appelé Magnéto, capable de créer de puissants champs magnétiques et prônant une attitude agressive envers les humains normaux, attitude probablement inspirée de son emprisonnement, lors de son enfance, dans un camp d'extermination nazi. Xavier a fondé, au nord de Salem (Massachusetts), un institut qui entraîne de nombreux élèves comme Tornade, Jean Grey et Cyclope. Les membres de cet institut, les X-men, essaient de contrer les actions de Magnéto et de ses acolytes. Une mutante, Malicia, dont les pouvoirs sont apparus à l'adolescence, peut absorber l'énergie vive d'une personne et s'approprier ses pouvoirs de façon temporaire ou définitive s'il s'agit d'un mutant. Faisant de l'auto-stop pour aller, probablement, en Alaska, elle rencontre, au Canada, Wolverine, un mutant aux capacités de regénération exceptionnelles. Ce dernier accepte de l'emmener dans son véhicule. Dent de Sabre, un mutant au service de Magnéto, les attaque, mais Malicia et Wolverine sont sauvés par Cyclope et Tornade. Ramenés à l'institut, Wolverine et le professeur Xavier concluent un pacte pour découvrir les intentions de Magnéto.
Magnéto fait kidnapper le sénateur Robert Kelly, favorable à une loi obligeant les mutants à révéler publiquement leur identité, par ses autres acolytes, Mystique et le Crapaud. Magnéto le soumet à une machine de son invention qui provoque une mutation chez les êtres humains normaux. Malicia est convaincue par Mystique, qui a pris l'apparence de Bobby Drake, qu'elle n'est pas la bienvenue à l'institut et quitte la résidence. Elle est enlevée par Magnéto, Dent de Sabre et le Crapaud malgré les efforts de Wolverine, Cyclope et Tornade pour la secourir.
Kelly s'échappe de sa prison mais, une fois arrivé à l'institut Xavier, sa mutation devient instable et il meurt. Xavier découvre cependant que Magnéto compte utiliser Malicia pour alimenter sa machine et tente de la localiser avec le Cerebro mais cet appareil a été saboté par Mystique et il tombe dans le coma. Jean Grey réussit à utiliser Cerebro et découvre que Malicia est retenue sur Liberty Island, Magneto comptant utiliser sa machine sur les leaders mondiaux réunis sur l'île voisine d'Ellis Island. Les X-Men se rendent donc à la statue de la Liberté et sauvent Malicia de la mort après un combat prolongé contre Magnéto et ses sbires. Après cette périlleuse mission, Wolverine décide de partir pour retrouver son passé et se dirige vers la base militaire de Alkali Lake. Xavier, qui est sorti de son coma, rend visite à Magnéto, désormais emprisonné dans une prison spéciale.
Un jour comme les autres, Gerry Lane et sa famille se retrouvent coincés dans un embouteillage monstre sur leur trajet quotidien. Ancien enquêteur des Nations Unies, Lane comprend immédiatement que la situation est inhabituelle. Tandis que les hélicoptères de la police sillonnent le ciel et que les motards quadrillent les rues, la ville bascule dans le chaos.
Les gens s'en prennent violemment les uns aux autres et un virus mortel semble se propager. Les êtres les plus pacifiques deviennent de redoutables ennemis. Or, les origines du fléau demeurent inconnues et le nombre de personnes infectées s'accroit tous les jours de manière exponentielle : on parle désormais de pandémie. Lorsque des hordes d'humains contaminés écrasent les armées de la planète et renversent les gouvernements les uns après les autres, Lane n'a d'autre choix que de reprendre du service pour protéger sa famille : il s'engage alors dans une quête effrénée à travers le monde pour identifier l'origine de cette menace et trouver un moyen d'enrayer sa propagation.
Sept ans ont passé depuis L'Affrontement final et la mort de nombreux mutants1. Logan, l'éternel guerrier marginal, vit reclus dans les montagnes et fait difficilement le deuil de Jean Grey. Sur invitation donnée par Yukio, une mutante capable de lire l'avenir et de voir les morts des autres, il se rend au Japon où Yashida, un ancien officier japonais dont il a sauvé la vie en 1945 lors du bombardement de Nagasaki, lui propose un marché : en échange de sa capacité à guérir, il s'engage à le rendre mortel à nouveau. Logan refuse.
La nuit suivante, Yashida décède, léguant l'entreprise familial à sa petite-fille Mariko, ce qui provoque le courroux du père de cette dernière et fils de Yashida, Shingen. Celui-ci, en collaboration avec Noburo Mori, le futur mari de Mariko (également ministre de la justice) engage des Yakuzas pour la lui ramener avant la mise en application du testament quelque jour plus tard.
Pendant l'enterrement du grand-père, les yakuzas tentent d'enlever Mariko, mais Logan la sauve ; pendant le combat, le mutant réalise vite que son corps ne guérit plus aussi vite qu'avant. Ils s'enfuient à bord du Shinkansen dans lequel se trouve d'autres Yakuzas. Après un combat sur le toit du train, Logan sorti vainqueur du combat et convainc Mariko de le laisser la protéger. Ils se réfugient dans un hôtel destinés aux couples. La nuit suivante, pendant que Mariko dort dans la chambre, Logan veille sur le balcon, sous une pluie battante. Alors qu'il repense à Jean Grey, il est attaqué, et tombe dans le vide. Il ne doit son salut qu'à Mariko, réveillée et habile au lancer de couteaux.
Les deux vont alors dans une maison dans le sud du Japon appartenant à la famille de Mariko. S'ils commencent à se rapprocher, Logan fait toujours des cauchemars en lien avec Jean Grey, et semble souffrir. Entretemps on apprend que La Vipère (Dr Green) et Kenichiro les recherchent.
Les Yakuza finissent par retrouver Mariko et l'enlèvent. Logan, qui n'a rien pu faire pour la sauver, en tue néanmoins un. Il recroise Yukio, et ils se rendent à la résidence familiale. Mais lorsqu'ils arrivent, Mariko est de nouveau partie avec Kenichiro, cette fois-ci. Shingen n'a pas pu les empêcher de partir. Découragé par Yukio, Logan cherche à se débarrasser d'un parasite enfoui dans son c?ur, qui est la cause de ses souffrances. Ils sont alors attaqué par Shingen, qui mourra des griffes de Logan.
Logan et Yukio se dirigent vers la grande tour où est retenue Mariko. Suite à un combat acharné contre les ninjas de Kenichiro, Logan est finalement endormi par une flèche spéciale de Kenichiro. Il est fait prisonnier sur une chaise, ses bras coincés. La Vipère le force à sortir ses griffes pour les lui faire couper par un golem d'adamantium. Pendant que Logan et Kenichiro, qui ne considérait la Vipère que comme un pion, combattent le golem, Yukio, enfin arrivée dans la tour, combat contre La Vipère. Logan voit ses griffes se briser, et Kenichiro meurt, pendant que Yukio réussit à tuer La Vipère.
En suspension dans les airs, contre la paroi de la tour, Logan est finalement rattrapé par le golem qui le ramène sur le plancher. C'est alors qu'on apprend que Yashida n'était pas mort : c'est lui qui contrôlait le golem de l'intérieur. Son objectif était de voler le pouvoir de Logan, pour le soulager, ou plutôt pour pouvoir lui-même être immortel. Finalement, Logan ressort des griffes, cette fois sous forme d'os, et fait dégringoler Yashida du haut de la tour, en guise d'adieu.
La scène suivante se passe à l'aéroport, où Logan et Yukio font leurs adieux à Mariko, puis l'avion décolle.
Pendant le générique de fin, une scène se passe à l'aéroport d'arrivée. Logan découvre à sa grande surprise que derrière lui se tient Magnéto, qui a retrouvé ses pouvoirs et lui annonce la création d'une arme par des humains destinée à anéantir les mutants. Peu enclin à le croire, Logan se trouve obligé d'en convenir lorsque le Professeur Xavier, vivant, apparait devant lui.
Le film se déroule dans une réalité alternative où les États-Unis et l'Union soviétique sont sur le point d'entrer en guerre et où un groupe de super-héros enquête sur une machination qui semble dirigée contre eux mais cache en fait un plan plus global.
1888. Après avoir tué Mr Hyde sur le toit de la Cathédrale Notre-Dame de Paris (allusion à Quasimodo), le célèbre chasseur de monstres, le Professeur Van Helsing, est envoyé en Transylvanie par le Vatican pour contrer le comte Dracula, qui utilise les recherches du Dr. Frankenstein, ainsi qu'un loup-garou, pour mener à bien de sinistres projets. Mais le professeur est secondé par Carl, un jeune moine assistant (nous rappelant un certain Q dans la série de films à succès James Bond), et par Anna Valérius (Kate Beckinsale).
Sur place seulement, il rencontre la belle Anna, qui pourchasse elle aussi le comte, qui a décimé toute sa famille. Après avoir vaincu l'une des trois femmes de Dracula, Van Helsing et Anna se rendent dans le château du comte, avec la ferme intention de le neutraliser pour toujours. Le Mal a-t-il trouvé un adversaire à sa hauteur ?...
Vers 2038, après une guerre à peine évoquée et un mystérieux virus utilisé lors d'un terrible attentat biologique visant trois sites importants par leur symbolique ou leur nombre de victimes (l'école primaire Sainte-Mary, la station de métro Victoria et une usine de traitement des eaux), l'Angleterre est dirigée par un parti fasciste après l'élection d'Adam Sutler. Ce dernier, ayant profité du climat de peur affectant la population, a facilement institué un régime dictatorial à la tête duquel il s'est autoproclamé « Haut Chancelier ». Un couvre-feu, dont le respect est contrôlé par sa milice, « Le Doigt », a été instauré sur tout le territoire. En parallèle, les migrants, les « païens », les musulmans, les malades physiques ou mentaux et tous ceux dont les idées pouvaient s'en approcher ont été bannis, et les opposants au régime ou minorités, tels les homosexuels, pourchassés lors de « L'assainissement ». Les plus élémentaires libertés fondamentales (la liberté d'expression en particulier) ont été abandonnées au nom de la sécurité nationale et de la guerre contre le terrorisme. Les médias sont muselés et la BTN, unique chaîne de télévision, est le principal instrument de propagande du parti.
Le soir du 4 novembre, un homme masqué et vêtu de noir, qui se fera connaître sous le nom de « V », sauve Evey Hammond des griffes des hommes du « Doigt » qui s'apprêtaient à la violer en guise de sanction alors qu'elle bravait le couvre-feu pour se rendre chez Gordon Deitrich, animateur et producteur à la BTN, où elle travaille également. V emmène Evey sur le toit d'un immeuble pour lui permettre d'assister à sa spectaculaire destruction de l'Old Bailey (l'une des Cours criminelles centrales de l'Angleterre), synchronisée avec la diffusion sur les ondes du parti de l'Ouverture solennelle 1812 de Tchaïkovski.
Le lendemain, les journalistes de la British Television Network (BTN) annoncent cependant que le gouvernement avait prévu de longue date la destruction du bâtiment. Au même instant, V prend le contrôle de la chaîne et diffuse une vidéo condamnant la politique du régime fasciste et blâmant aussi les citoyens de laisser le parti les priver ainsi de leurs libertés. V demande instamment à la population de se soulever contre l'oppression le 5 novembre, pour la nuit de Guy Fawkes, un an plus tard jour pour jour. V annonce qu'il détruira ce jour-là le Palais de Westminster (les Chambres du Parlement), autre bâtiment symbolique du Royaume-Uni.
L'armée lance un assaut contre la Tour Jordan, siège de la BTN, prise en otage par V. Celui-ci a amorcé une bombe et a vêtu tous les otages d'un costume et d'un masque à son image afin de faciliter sa fuite. Evey, présente également ce jour-là, est blessée en voulant aider V à s'échapper. Pour la protéger des autorités, celui-ci la ramène dans sa tanière, « La Galerie des Ombres ». Là, Evey apprend qu'elle doit rester cachée avec son hôte pendant un an, jusqu'à ce que le plan de ce dernier soit mené à bien. Ses origines (fille d'activistes démocrates disparus, s?ur d'une jeune victime de l'attentat de Sainte-Mary) font rapidement d'elle une fugitive recherchée par le régime en place, l'inspecteur Finch étant chargé de l'enquête sur la jeune femme ainsi que sur V.
Les roses Scarlet Carson (variété imaginaire), déposées près des victimes de V.
Evey accepte finalement de rester, jusqu'à ce qu'elle apprenne que V est à l'origine de la mort de Lewis Prothero, le présentateur d'une émission télévisée de propagande en faveur du gouvernement, qui a joué un rôle, selon lui, dans l'extermination des opposants et des minorités. Lorsque V lui demande de l'aider à éliminer l'évêque Lilliman, Evey accepte en pensant ainsi à un moyen de s'enfuir, de peur d'être condamnée pour l'avoir aidé. Au moment où V s'apprête à tuer l'évêque, Evey, paniquée, en profite pour s'échapper. Elle trouve refuge chez son ancien patron et ami, l'animateur Gordon Deitrich, un homosexuel contraint de taire son orientation sexuelle de peur d'être arrêté. Pendant ce temps, V, continuant sa vendetta personnelle, élimine le Dr Delia Surridge, qui manifeste du remords et s'excuse pour ses actions passées.
Après une émission satirique de Deitrich contre le Chancelier Sutler, la police secrète mène un raid contre sa maison, et Gordon a juste le temps de prévenir Evey avant de se faire arrêter. Alors qu'elle pensait être parvenue à s'échapper discrètement par le jardin, Evey est capturée par un policier resté en arrière. Elle est alors incarcérée puis torturée pendant plusieurs jours dans le but de lui faire avouer, entre autres, où se cache V. Durant son isolement, elle va trouver une sorte de refuge et de leçon de vie en découvrant les notes d'une ancienne prisonnière lesbienne, Valérie Page.
Valérie fut arrêtée lors de la « Grande Purge » quelques années auparavant, et emprisonnée à Larkhill où elle fut également torturée. Elle décida malgré tout de laisser une trace de son passage en écrivant sa biographie sur du papier toilette. Après cette lecture, ses tortionnaires posent à Evey un ultimatum en lui ordonnant de révéler la cachette de V sous peine de mort. Ayant repris courage, elle refuse d'accéder à leur requête et leur annonce qu'elle préfère mourir. À son grand étonnement, elle est libérée sur-le-champ et découvre qu'elle était retenue par V, qui avait revêtu plusieurs identités pour tromper Evey durant son incarcération. Passées la colère et la suffocation d'Evey, V lui explique que le fait de la confronter à sa propre mort était le seul moyen de lui faire accepter plus sereinement cette éventualité et ne plus craindre ses véritables idées. V laisse ensuite Evey repartir, lui faisant promettre de revenir le voir avant le 5 novembre.
Pendant ce temps, l'inspecteur Finch en apprend plus sur les origines de V. Il découvre comment la Norsefire ? le parti fasciste du « Feu Nordique » ? est arrivée au pouvoir. Vingt ans plus tôt, alors que le Royaume-Uni était en proie au chaos, le parti conservateur conduisit une répression afin de ramener l'ordre. Ainsi, les soi-disant ennemis de l'État, étrangers, musulmans, homosexuels, libéraux et opposants à la guerre, furent soumis à des rafles et beaucoup disparurent sans laisser de trace. Le pays fut profondément divisé face à cet événement, jusqu'à ce qu'une attaque bioterroriste tue environ 80 000 personnes. Une compagnie pharmaceutique appartenant à la Norsefire découvrit bientôt un traitement contre le virus, permettant au parti de s'enrichir rapidement grâce à la distribution du vaccin. La peur générée par l'attaque terroriste permit à la Norsefire de faire taire l'opposition et de gagner largement l'élection suivante. Avec le consentement silencieux des citoyens (à l'exception de quelques résistants, dont les parents d'Evey), la Norsefire transforma le Royaume-Uni en un État policier totalitaire, avec son chef Adam Sutler autoproclamé « Haut Chancelier ».
L'inspecteur Finch découvre que l'attaque terroriste avait été élaborée par la Norsefire dans le cadre d'un complot pour accéder au pouvoir. Le virus ? ainsi que son traitement ? a été conçu grâce à l'expérimentation humaine sur les « indésirables » et les dissidents politiques internés au centre de détention de Larkhill, où travaillaient alors Prothero, Lilliman et Surridge. Parmi les détenus se trouvait l'homme qui est devenu V. Alors que les autres sujets testés mouraient à la suite des expériences, l'occupant de la cellule 5 (V en chiffres romains) a acquis des aptitudes mentales et physiques accrues, au prix de sa défiguration et de la déformation de son esprit. Ces capacités ont permis à V de détruire le camp de Larkhill et de s'échapper, après s'être engagé à prendre sa revanche sur le régime de la Norsefire.
Tandis que l'inspecteur Finch éclaircit le mystère autour des histoires d'Evey et de V, ce dernier provoque le bras droit de Sutler, Peter Creedy, également chef de la milice, en établissant avec lui un pacte faustien : comme il ne peut pas atteindre Sutler en raison de la sécurité dont il bénéficie, il propose à Creedy (seul responsable du plan d'évacuation du Haut Chancelier en cas de révolte populaire) de l'amener à lui en échange de sa propre reddition, le 5 novembre. Creedy accepte, y voyant un moyen à la fois d'éliminer le terroriste et de prendre la place de Sutler.
Alors que le 5 novembre approche, les plans de V provoquent le chaos au Royaume-Uni et la population se montre de plus en plus rebelle et subversive face à l'autorité du gouvernement. La veille du 5 novembre, Evey rend visite à V, qui lui dévoile enfin son plan : un train bourré d'explosifs va rouler jusqu'au Parlement sur les lignes condamnées du métro. Il confie alors le lancement du train à Evey, lui laissant le choix de terminer son plan ou non, estimant que la décision finale n'est plus son affaire, mais celle des générations suivantes incarnées à ses yeux par la jeune fille présente.
V rencontre finalement Creedy, qui s'est emparé de Sutler, dans la Station Victoria. Creedy tue Sutler, mais comme V refuse d'ôter son masque devant lui, il ordonne à ses hommes de lancer leur attaque. Seul contre une douzaine d'hommes armés, V les supprime tous avant d'étrangler Creedy. Touché par plusieurs balles, il est grièvement blessé mais encore vivant grâce à une armure dissimulée sous son costume et à sa force surhumaine. Il retourne avec difficulté auprès d'Evey pour lui dire adieu. Il lui avoue son amour avant de mourir, et Evey étend son corps dans le train avec les explosifs, comme il le souhaitait.
Alors qu'elle est sur le point de faire démarrer le train, Evey est interrompue par l'arrivée de l'inspecteur Finch. Toutefois, en raison de ce qu'il a appris sur la corruption du régime, Finch lui permet de respecter les v?ux de V. Pendant ce temps, des milliers de personnes déguisées en Guy Fawkes marchent sur le Parlement pour assister au spectacle. Sutler et Creedy étant morts, personne n'ordonne aux soldats de faire feu sur les manifestants, et ceux-ci envahissent sans violence les rues encerclant Westminster. L'explosion illumine le ciel de Londres et le Parlement est détruit tandis qu'est diffusée sur les ondes publiques l'Ouverture solennelle 1812 de Tchaïkovski.
Sur le toit d'un immeuble voisin, Evey et Finch assistent à l'explosion et Finch interroge Evey sur l'identité de V. Evey lui répond qu'il était Edmond Dantès, personnage principal du Comte de Monte-Cristo, et lui explique qu'il était la représentation du peuple. On voit alors certaines personnes retirer leurs masques et les visages vus sont ceux de chaque personne ayant été tuée par le parti et apparaissant dans le film.
Les humains ont découvert l'existence des vampires et des lycans et tentent de les exterminer jusqu'à l'extinction. Selene (Kate Beckinsale) est capturée par les humains. Elle se réveille en plein milieu d'un complexe scientifique appelé « Antigen » après avoir été plongée dans un coma artificiel pendant 12 ans. Elle découvre que le monde qu'elle connaissait a bien changé pendant ce temps, mais garde espoir de retrouver Michael.
Selene rencontre Eve (India Eisley), une jeune adolescente qui se révèle non seulement être un hybride des deux espèces, mais également sa fille. Selene et Eve trouvent refuge auprès d'un groupe de vampires dont fait partie David (Theo James). Rapidement, le refuge est attaqué par un groupe de lycans mené par un nouveau genre de loup-garou, plus grand, plus fort et insensible à l'argent. Thomas, chef du groupe et père de David, leur livre Eve quand Selene est vaincue.
Selene en est persuadée : les lycans n'ont pas disparu, mais ils préparent leur retour grâce à Antigen, et ils ont besoin d'Eve pour cela. En effet, le plan du Dr Jacob Lane est d'utiliser les ovules d'Eve pour engendrer des clones de lycans bénéficiant des effets du vaccin développés avec le sang d'Eve. Avec le détective Sebastian, Selene prépare sa contre-attaque pour libérer Eve.
Au Moyen Âge, les lycans (loups-garous) sont les esclaves des vampires. Lucian, le premier des lycans capable de reprendre forme humaine, et Sonja, la fille de Viktor le chef des vampires, sont secrètement amoureux l'un de l'autre. Une nuit, Sonja mène des gardes et tue les lycans qui sont derrière les murs de la cité des vampires. Sonja part avec des guerriers dans la forêt pour protéger un baron humain mais elle se retrouve à livrer une bataille contre les lycans. Lucian prédit que ceux-ci seront plus nombreux et la rejoint, ayant créé une clé pour se libérer du collier que les vampires mettent aux cous des hommes pour les empêcher de se transformer en loup-garou. Il enlève son collier, et se transforme pour sauver Sonja. Viktor, averti de ce qui se passe, se mêle au combat, et punit Lucian en le fouettant en public. Sonja, qui a assisté à la scène, est bouleversée.
Lucian et les lycans retenus prisonniers imaginent un plan pour se libérer. Lucian détruit le Gardien qui le menaçait, Sonja menace le lieutenant de Viktor, au courant de sa liaison, puis pactise avec lui en échange de sa place au Conseil des Vampires. Celui-ci donne une clé à Lucian pour le libérer. Sonja aide les lycans à s'enfuir, tandis que le lieutenant de Viktor ment à celui-ci. Viktor le croit, mais découvre que Sonja a aidé les Lycans à s'évader. Quand Lucian revient dans la forteresse pour emmener Sonja avec lui, le père et la fille s'affrontent violemment, et Viktor est prêt à tuer sa propre fille lorsqu'elle lui apprend qu'elle est enceinte. Lucian est attaché, et Sonja est condamnée à mourir. Lucian survit au fouet encore une fois, et voit mourir sous ses yeux Sonja, exposée à la lumière du jour qui la réduit en cendres. Lucian se transforme en loup-garou et essaye de tuer Viktor, il appelle les autres lycans et la guerre éclate. Lucian affronte Viktor et le tue, les vampires sont vaincus. Les Lycans le félicitent, mais Lucian annonce que cela ne fait que commencer.
À la fin, on voit sur un bateau Viktor toujours vivant. La dernière scène est une reprise d'une des scènes du premier opus où l'on voit Sélène observer le monde des humains bien des siècles plus tard, avec la voix off de Kraven, reprise là aussi du premier opus, expliquant à celle-ci la vérité sur ses origines. C'est le début d'une guerre sans merci...
Au xiiie siècle, une armée de vampires dirigée par Markus, Viktor et Amelia arrivent dans un village décimé par les loup-garous (à ne pas confondre avec les Lycans qui sont des mi-Loup-Garou, mi-humains). Après avoir éliminé les loup-garous, Viktor et Amelia capturent William, le frère jumeau de Marcus, devenu le plus puissant des loup-garous. Malgré la résistance de Marcus, Viktor décide d'enfermer William dans un lieu tenu secret.
De nos jours. Après avoir tué Viktor, qui a assassiné ses parents, Selene, la guerrière vampire retrouve refuge dans un lieu de sécurité avec Michael, devenu hybride mi-vampire, mi-lycan, afin qu'elle puisse retourner au château faire face à Kraven, dont elle sait qu'il a l'intention de tuer Markus. Mais toutefois, Markus se réveille grâce au sang de Singe (scientifique des Lycans tué par Viktor), le transformant ainsi en un être hybride dominant. Kraven et ses hommes, qui se sont rendus dans la demeure des vampires, sont sauvagement assassinés par ce dernier qui détruit le château. Il apprend où se trouvent Selene et Michael grâce aux diverses caméras de surveillance se trouvant dans les divers bâtiments de sécurité afin de les traquer. Markus les retrouve et les attaque, mais la guerrière et l'hybride parviennent à lui échapper à se cacher dans un entrepôt.
Pendant ce temps, un homme âgé et imposant du nom de Lorenz Macaro envoie une équipe de « nettoyage » pour enquêter sur les circonstances de la bataille dans le repaire des Lycans. Lorsque Macaro autopsie le corps de Viktor, qui a été récupéré sur les lieux, il découvre un disque en métal dans à sa cage thoracique lié au pendentif de Sonja, qui est en la possession de Selene et de Michael.
Sachant que le pendentif a une importance pour Marcus, Selene, dont des souvenirs commencent à resurgir grâce au pendentif, décide d'en savoir plus, en allant voir Andreas Tanis, historien banni du clan des vampires, qui lui révèle que Markus est le premier vampire et non Viktor et également l'un des trois enfants d'Alexander Corvinus, le premier immortel. Markus ayant été mordu par une chauve-souris est devenu un vampire, tandis que son frère jumeau, William, mordu par un loup, est devenu un lycan. Le troisième fils est celui qui a donné une descendance à la famille Corvinus, dont fait partie Michael. Ils apprennent également que les lycans étaient incapables de reprendre forme humaine et qu'en raison du caractère destructif de son frère, Markus a approché Viktor, alors seigneur de la guerre vieillissant et mourant, lui offrant ainsi l'immortalité, ainsi qu'à son armée, chargé d'arrêter le Lycan et ceux transformés.
Markus avait prévu de capturer William, mais Viktor a fait finalement enfermer William pour toujours et n'a pas tué les frères parce qu'il croyait que cela entraînerait la disparition immédiate de tous les autres vampires et des lycan, devenu esclaves. Tanis révèle également que le père de Selene a construit le tombeau de William et que le pendentif est une clef servant à ouvrir le tombeau. Après que Lucian se soit échappé, Viktor a fait éliminer la famille de la jeune femme car ils connaissaient le lieu d'enfermement, mais a fait transformer Selene en vampire.
L'historien donne à Selene les coordonnées de Lorenz Macaro, qui se révèle être Alexander Corvinus, réfugié dans un bateau. Il indique avoir consacré sa vie à contenir la guerre vampire-lycan loin du monde des mortels, mais refuse cependant de tuer son fils. Quand Markus, après s'être rendu chez Tanis où il apprend la vérité en buvant son sang et en laissant inconscient, débarque dans le bateau où se trouve son père, il tue Michael et s'empare du pendentif en blessant gravement son père. Mourant, Corvinus donne de son sang à Selene, améliorant sa force physique et ses capacités de guérison à un niveau équivalent à celui d'un hybride, et lui demande d'arrêter son fils, car le réveil de William engendrerait une catastrophe pour l'humanité. Le vieil immortel se suicide en faisant sauter le bateau avec des explosifs.
Accompagné de l'équipe de nettoyeurs, Selene se rend au tombeau, endroit qu'elle connaissait bien, mais trop tard, car William est réveillé. Un combat s'ensuit, décimant toute l'équipe. Mais Michael, alors qu'il était présumé mort, se régènere subitement et saute de l'hélicoptère, se joignant dans la lutte sous sa forme hybride et finit par achever William, en lui arrachant la tête. Selene tue Marcus, après l'avoir affronté, avec les pales tournantes de l'hélicoptère écrasé.
Les amants triomphent et lèvent ainsi une malédiction, permettant à Selene de voir la lumière du jour et de vivre sans être blessée par le soleil, grâce au sang d'Alexander Corvinus.
Selene est une guerrière vampire puissante. Dans la lutte qui oppose depuis des siècles son peuple à celui des Lycans, des loups-garous, elle est reconnue pour être l'une des tueuses les plus efficaces. Jusqu'au jour où elle tombe amoureuse de Michael Corvin, un humain qui se retrouve pris malgré lui dans l'affrontement des deux clans. Mordu par l'un des loups-garous, il devient rapidement l'un d'entre eux. Entre passion et devoir, Selene doit alors choisir son camp...
David Dunn (Bruce Willis), un banal gardien de sécurité de Philadelphie, est le seul survivant d'une catastrophe ferroviaire. À la grande surprise des autorités et des médias, l'homme s'en sort indemne, sans la moindre blessure ou traumatisme. Troublé par cet événement, Dunn entre dans une crise d'identité. Qui est-il ? Pourquoi a-t-il survécu ? C'est en quête de réponses qu'il rencontre Elijah Price (Samuel L. Jackson), un handicapé misanthrope frappé d'ostéogenèse imparfaite.
Thomas Jefferson Johnson est un petit escroc qui devient vite un grand politicien, par des méthodes un peu douteuses. Il obtient donc un siège au congrès américain. C'est alors qu'il va dénoncer une intrigue politique et se faire énormément d'argent sans avoir besoin d'user de ses dons d'escrocs et uniquement grâce à son pouvoir nouvellement acquis !
Vers la fin du xxie siècle, une jeune femme appelée Violet est victime d'une maladie appelée hémophagie, qui donne aux individus des capacités surhumaines mais raccourcit leur durée de vie. Ces « hémophages » présentent des similitudes avec les vampires et le gouvernement tente de les exterminer. Violet croise le chemin d'un jeune garçon qui est l'une des cibles des desseins du gouvernement. Elle doit le protéger et découvrir pourquoi il est si important.
La presse se fait écho de la réapparition d'une page manquante du journal de John Wilkes Booth, l'assassin d'Abraham Lincoln. Cette page contient des informations qui associent l'arrière-arrière-grand-père de Benjamin Gates à cet assassinat lui donnant même un rôle clé. Ben entame alors une quête pour disculper son aïeul. Elle l'emmène à Paris, à Londres et de retour aux États-Unis pour chercher un mystérieux livre qui contiendrait tous les secrets de notre monde transmis depuis la Guerre de Sécession à chacun des présidents américains.
Benjamin Gates dit Ben suit les traces de la famille Gates, en voulant mettre la main sur le fameux trésor des Templiers, d'une valeur incommensurable, qui aurait été caché par les Francs-Maçons durant la guerre d'indépendance des États-Unis d'Amérique. Toutefois cette quête n'est pas une mince affaire car on ne peut atteindre le trésor qu'en suivant un indice aboutissant généralement lui aussi à un autre indice.
C'est ainsi qu'un beau jour, Ben et son équipe découvrent sur un bateau en Arctique, la Charlotte, un indice qui lui laisse penser que le prochain sera présent au dos de la Déclaration d'indépendance des États-Unis. À la suite d'une trahison de plusieurs de ses équipiers, il décide de la voler (avec l'aide de son meilleur ami Riley) dans le but de la protéger et de savoir si le nouvel indice est bien là où il pense qu'il est. S'ensuit une course aux indices, avec à ses trousses le FBI ainsi que les anciens équipiers de Gates qui souhaitent lui mettre la main dessus.
Wyatt Earp, ancien marshal à la réputation légendaire, décide de prendre sa retraite et de couler des jours paisibles dans la ville minière de Tombstone, alors en pleine expansion. Il y retrouve ses frères Virgil et Morgan et leurs épouses, ainsi que son ami Doc Holliday, joueur et fine gâchette atteint de tuberculose. Wyatt parvient rapidement à devenir associé dans un saloon alors que sa femme Mattie devient dépendante du laudanum. Peu après, Wyatt et Doc Holliday ont quelques frictions avec une bande de hors-la-loi, les Cowboys, dirigée par Curly Bill Brocius et Johnny Ringo, un dangereux sociopathe avec qui Holliday développe très vite une inimitié réciproque.
Après un dramatique évènement, le meurtre par Curly Bill du marshal de la ville, Wyatt neutralise et emprisonne Curly Bill. Mais celui-ci est libéré peu après et les Cowboys jurent de se venger. Wyatt fait également la connaissance de Josephine Marcus, une comédienne de théâtre qui ne cache pas son intérêt pour lui et qui l'attire également, et doit faire de grands efforts pour résister à cette attirance. Virgil Earp, écœuré par l'impunité avec laquelle les Cowboys sèment le trouble, décide de devenir marshal de Tombstone et interdit de porter des armes à feu dans la ville. Cette décision entraîne la fusillade d'O.K. Corral au cours de laquelle trois Cowboys sont tués par les Earp et Holliday. En représailles, les hors-la-loi assassinent Morgan Earp et blessent gravement Virgil. Wyatt redevient alors marshal et, avec l'aide de Doc Holliday et quelques autres, commence à traquer impitoyablement les membres du gang de Curly Bill et Ringo.
Au cours d'une embuscade tendue par les Cowboys, Wyatt parvient à tuer Curly Bill. Peu après, l'état de santé de Doc Holliday s'aggrave et le petit groupe doit chercher refuge dans un ranch. Wyatt y rencontre Josephine et finit par réaliser qu'il veut refaire sa vie avec elle. Mais Ringo, qui est à présent le chef des Cowboys, propose un duel à Wyatt pour régler définitivement leur querelle. Wyatt accepte, même s'il sait que son adversaire est plus rapide que lui. Doc Holliday, malgré son état, devance Wyatt sur le lieu convenu pour le duel et tue Ringo. Après cela, ils éliminent ou chassent du pays tout le reste de la bande.
Quelque temps plus tard, Doc Holliday, désormais à l'agonie, est alité dans un sanatorium. Wyatt lui rend visite quotidiennement mais Doc le persuade de le laisser mourir et de partir retrouver Josephine afin de pouvoir enfin vivre sa vie comme il l'entend. Doc meurt peu après alors que Wyatt et Josephine resteront inséparables jusqu'en 1929, date de la mort de Wyatt.
Après avoir battu leur ennemi de toujours, Shredder, Leonardo, Raphael, Donatello et Michelangelo se sont éloignés les uns des autres et ne se parlent plus beaucoup. Leur vieux maître et père adoptif, Splinter essaie tant bien que mal de maintenir leur cohésion. De plus, il sent qu'une menace plane sur New York...
En effet, Max Winters, un richissime industriel, prévoit de se construire une vaste armée pour conquérir le monde. Les Tortues Ninja, aidées de leurs amis fidèles April O'Neil et Casey Jones, vont devoir à nouveau livrer bataille ensemble pour sauver la ville...
En septembre 1996, Brock Lovett est le coordinateur d'une équipe qui fouille méticuleusement l'épave du Titanic, paquebot géant réputé insubmersible qui connut pourtant un destin tragique. Lors d'une plongée en sous-marin miniature, il espère mettre enfin la main sur le C?ur de l'Océan, un bijou unique à la valeur inestimable, porté par Louis XVI, dont la découverte lui apporterait la gloire (ce bijou est inspiré du diamant bleu de la Couronne). Mais il remonte des profondeurs un coffre-fort qui se révèle ne contenir qu'un dessin représentant une jeune fille nue portant le bijou en pendentif.
À des milliers de kilomètres de là, une vieille dame, Rose Calvert (passagère fictive), découvre ce dessin sur l'écran de son téléviseur. Elle contacte Lovett et lui affirme qu'elle est la jeune fille en question. Étant l'une des rares personnes à avoir survécu au naufrage du Titanic encore en vie, elle raconte à Lovett et à son équipe la croisière inaugurale du paquebot, son naufrage, ainsi que l'histoire d'amour qu'elle a vécue avec Jack Dawson, un artiste voyageant en troisième classe.
Le 10 avril 1912, elle embarque en effet sur le Titanic avec son fiancé, Caledon Hockley, sa mère, Ruth, et leurs domestiques. Pendant ce temps, dans un pub du port, quatre hommes disputent une partie de poker. Deux d'entre eux, Olaf et Sven, ont misé leurs billets de troisième classe pour le Titanic, billets que remportent finalement leurs adversaires, Jack et Fabrizio. Ceux-ci embarquent ainsi sur le paquebot. Alors que commence la traversée, Rose se sent de plus en plus piégée par une haute société qui veut lui faire épouser un homme qu'elle n'aime pas. Finalement, le soir du vendredi 12 avril, après le dîner, elle tente de se suicider en sautant de l'arrière du navire. Jack, qui flânait sur le pont, se précipite à son secours et réussit à la sauver. Lorsque Cal et d'autres passagers arrivent sur les lieux, ils décident d'inviter Jack à dîner avec eux en première classe pour le remercier.
Reproduction du C?ur de l'Océan, bijou au centre de l'action du film.
Le lendemain, samedi 13 avril, Jack et Rose passent la journée ensemble sur le pont du Titanic, discutant de leur vie. Rose envie l'indépendance de Jack et son absence d'attaches. Avec l'aide de Margaret « Molly » Brown, Jack réussit à se rendre présentable pour le dîner où la plupart des invités se montrent amicaux, à l'exception de Ruth et de Cal qui n'affichent que du mépris à son égard. Il est également présenté à de riches passagers, comme le milliardaire John Jacob Astor et sa jeune épouse Madeleine. Après le repas, Jack invite Rose à une fête en troisième classe, sans savoir qu'ils sont épiés par le valet de Cal, Lovejoy.
Le matin suivant, dimanche 14 avril, Cal s'énerve contre Rose et la sermonne sur ce qu'une bonne future épouse se doit d'être. Sa mère exprime également ses craintes : si le mariage n'a pas lieu, leur famille, ruinée, perdra tout. Rose décide donc de se sacrifier pour le bien de sa mère. Jack s'introduit frauduleusement en première classe pour la raisonner, mais en vain : Rose refuse. Ce n'est qu'au coucher du soleil qu'elle se décide à le rejoindre et à quitter le carcan dû à son rang. Elle demande à Jack de la dessiner nue, ne portant que le C?ur de l'Océan offert peu de temps avant par Cal. Après s'être exécuté, Jack et Rose sont obligés de fuir Lovejoy, se réfugiant dans les salles des chaudières puis dans la cale, où ils font l'amour. Peu après être ressortis sur le pont, ils assistent à la collision du Titanic avec un iceberg.
Tous deux décident d'aller prévenir Ruth et Cal et retournent à la cabine de Rose, mais en chemin, Lovejoy glisse le bijou dans la poche de Jack, qui est accusé du vol et enfermé dans le bureau du capitaine d'armes. Rose, mise au courant de la gravité de la situation par le concepteur du navire, Thomas Andrews, se prépare à monter dans un canot avec sa mère, mais change d'avis au dernier moment et se précipite au secours de Jack. Après sa libération, tous deux réussissent à gagner le pont des embarcations. Jack et Cal persuadent Rose de monter dans un canot (Cal a en effet un arrangement avec le premier officier William Murdoch et fait croire à Rose que Jack en profitera aussi), mais celle-ci s'enfuit à nouveau.
Jack et Rose sont alors poursuivis par Cal, qui s'est emparé d'une arme. Finalement, celui-ci abandonne pour sauver sa propre vie et remonte sur le pont. Cependant, dans la panique, l'officier lui rend son argent et après avoir tué deux passagers, se suicide. Cal s'empare alors d'une fillette et l'utilise comme prétexte pour embarquer sur un des derniers canots. Jack et Rose rencontrent Andrews dans le fumoir (celui-ci a décidé de sombrer avec le paquebot), et sont finalement contraints de se réfugier sur le pont arrière. Pendant ce temps, Fabrizio, l'ami de Jack, est tué par la chute de la première cheminée du paquebot. Lorsque le navire sombre, les deux amants se retrouvent dans l'eau glacée et trouvent pour refuge une pièce de boiserie. Seule Rose peut monter dessus, et Jack se laisse mourir pour elle. Rose réussit à signaler sa présence au canot de l'officier Harold Lowe, venu chercher des survivants. Les rescapés du naufrage sont pris à bord du Carpathia au matin du lundi 15 avril, Rose comprise. À son arrivée à New York le 18 avril, elle donne pour nom à l'homme qui établit une liste de rescapés « Rose Dawson », et ne donne plus de signe de vie à sa famille.
De retour en 1996, Rose conclut son histoire, expliquant que Cal, à sa connaissance, s'est suicidé pendant la Grande Dépression. Nul ne sait ce qu'il est advenu du C?ur de l'Océan, mais Brock Lovett déclare avoir enfin compris le sens de l'histoire du Titanic. La nuit venue, Rose jette le bijou dans l'Atlantique (il était en réalité resté en sa possession la nuit du naufrage), puis s'endort ou meurt dans sa cabine (l'interprétation restant confuse pour le spectateur). Elle rejoint Jack et toutes les victimes du naufrage dans le Grand Escalier du Titanic pour un baiser final.
Après les évènements de Sokovie et l'affrontement avec UltronN 1, Thor est parti à la recherche des Pierres d'Infinité. Deux ans plus tard, sans résultat, il finit emprisonné dans le monde de Surtur (Muspellheim). Il se libère et vainc le démon enflammé, après que ce dernier lui a appris qu'Asgard est sans défense en l'absence du « Père de Toute Chose », Odin. Thor lui arrache sa couronne que le démon comptait unir avec l'Éternelle Flamme afin de provoquer le Ragnarök, la destruction d’Asgard.
Le dieu du Tonnerre revient à Asgard avec ce trophée, constatant qu'Heimdall a été chassé et remplacé par Skurge pour trahison et qu'Asgard a sombré dans la décadence sous le règne de Loki. Il démasque son frère Loki sous les traits d'Odin puis l’emmène sur Terre afin de ramener leur père, laissé dans une maison de retraite à New York qui a été entre-temps fermée. Avec l'aide du Docteur Strange, qui veut voir les Asgardiens quitter la Terre au plus vite, ils retrouvent Odin en Norvège au bord de la côte. Ce dernier leur révèle être mourant et ce que sa mort entraînera.
La mort soudaine d'Odin permet la libération de leur sœur aînée Hela, Déesse de la Mort, qui clame son droit au trône d'Asgard et brise aisément le marteau de Thor. Loki, terrifié face au sort de l'arme fétiche de son frère, ordonne qu'on les ramène à Asgard. Hela profite du Bifröst ouvert pour se rendre à Asgard, source de son pouvoir, et se débarrasse des deux Asgardiens en leur faisant quitter de force le faisceau. Elle arrive à destination et tue sans difficulté Volstagg et Fandral alors que Skurge préfère se soumettre. L'aînée d'Odin atteint la cité et se débarrasse à elle seule sans problème de la garde asgardienne tout entière menée par Hogun. Elle révèle l'histoire cachée du Royaume des Dieux à son nouveau serviteur, faite de conquêtes et de massacres perpétrés par Odin et sa fille, jusqu'à ce qu'Odin renonce aux tueries et bannisse sa fille, trop ambitieuse de pouvoir, dans une prison dimensionnelle. Elle pénètre ensuite dans la chambre forte, expliquant que la plupart des « trésors » qu'elle renferme, dont le Gant d'Infinité, sont factices ou de peu d'intérêt, à part le Tesseract, puis s'empare d'une braise de l'Éternelle Flamme et s'en sert pour faire resurgir des catacombes de la cité les Asgardiens morts lors de ses conquêtes et inhumés dans celles-ci ainsi que Fenris, un loup géant, ancienne monture de la déesse de la Mort. Elle les prend sous son contrôle et commence à asservir Asgard.
Thor échoue sur la décharge de Sakaar, un monde entouré de portails cosmiques. Il est rapidement fait prisonnier par une jeune femme et conduit devant le Grand Maître, gouverneur de ce monde et créateur du tournoi des champions. Thor remarque la présence de son frère à proximité et tente d'attirer son attention. Loki essaie de l'ignorer, mais Thor révèle leur parenté au Grand Maître, intrigué. Loki explique à son demi-frère qu'après plusieurs semaines, il a finalement réussi à s'attirer les faveurs de leur hôte, ce qui surprend Thor car il n'est sur ce monde que depuis quelques heures, le temps s'écoulant plus lentement en dehors de ce monde. Le dieu prisonnier explique que la situation de son monde est préoccupante et qu'il doit quitter l'endroit au plus vite, mais le Grand Maître lui indique que le seul moyen de quitter Sakaar est de vaincre son « champion » en combat singulier. Thor, persuadé de pouvoir l'emporter, accepte.
Avant l'affrontement, il rencontre les autres gladiateurs dont Korg, un être composé de pierres qui se présente comme leur chef. Une fois à l'armurerie, il revoit sa geôlière et tente de la convaincre de le libérer mais elle le neutralise avec un implant délivrant une puissante décharge électrique qu'elle lui a posé lors de sa capture. Son nouvel ami le met en garde contre « ces Asgardiens » qui ne sont pas faciles à tuer. Thor retente alors sa chance, jouant sur la corde du patriotisme et remarque un tatouage sur son poignet, celui de l'ordre des Valkyries (les guerrières d'élite d'Asgard). Il est malheureusement confronté à un mur et prend une autre décharge.
Après avoir été habillé et coiffé pour le combat (perdant de force ses cheveux longs), Thor se retrouve dans l'arène sous le nom de « Lord du Tonnerre ». Lorsque son adversaire apparaît, il exulte à la surprise du public tout entier alors que Loki se décompose : le champion en titre est Hulk, porté disparu depuis les événements de la SokovieN 1. Alors que Thor explique que le colosse émeraude est un « collègue de travail », ce dernier colle un coup brutal à son ami et lui fait traverser l'arène pour s'écraser contre l'une des parois. Thor est rapidement dépassé même en tentant de faire appel à Banner dans l’inconscient de la créature, mais réussit à porter un coup qui sonne son ami. Il tente d'utiliser la technique de relaxation utilisée par Natasha RomanoffN 1 pour le calmer, mais cela échoue et il subit le même sort que Loki lors de l'attaque sur New YorkN 2, à la grande satisfaction de ce dernier. Alors qu'il est sur le point d'être tué, une vision de son père le dote soudain de la puissance du tonnerre qui lui permet de repousser Hulk en lui envoyant des éclairs. Il semble être sur le point de porter le coup de grâce quand le Grand Maître active son implant et le neutralise. Se réveillant dans la chambre de Hulk, il découvre que celui-ci est arrivé en Quinjet après sa fuite et est resté sous sa forme « verte » depuis deux ans. Après une dispute avec lui, il découvre également le lien d'amitié entre lui et la Valkyrie qui l'a fait prisonnier.
Se sentant perdu, il fait appel à Heimdall via la vue omnisciente de ce dernier qui lui révèle qu'Hela prend le contrôle d'Asgard avec Skurge comme Exécuteur et que la seule chose qui l'a empêchée de commencer la conquête de l'univers est la disparition de l'épée qui active le Bifröst, fait dont il est responsable. Il explique ensuite à son prince que pour rejoindre Asgard après avoir quitté Sakaar, il doit passer par le plus gros des portails au-dessus du monde.
Armé de toutes ces informations, Thor convainc Hulk de faire venir la Valkyrie, puis l'affronte et décrit à la jeune femme la situation d'Asgard et l'amène à expliquer les raisons de son exil dans cet endroit. Elle lui révèle que lorsque Odin a banni Hela, elle ne s'est pas laissée faire, qu'il a envoyé les Valkyries la neutraliser, qu'Hela a détruit ses adversaires et que la jeune femme fut la seule survivante. Thor lui révèle qu'Odin est mort. Il révèle aussi que lors de leur petite rixe, il a subtilisé la télécommande de son implant et le désactive, puis prend la fuite en sautant par la fenêtre avant de rejoindre le Quinjet pour quitter ce monde. Hulk avait clairement fait comprendre qu'il ne quitterait jamais un monde où il est acclamé pour un monde où il est méprisé, mais il n'accepte pas que son seul adversaire valable (et l'un de ses seuls amis) s'en aille et détruit le fuselage de l'appareil. Le dieu du Tonnerre, essayant d'activer la propulsion avant qu'elle ne soit entièrement détruite, met en route le dernier message laissé par Natasha RomanoffN 1, ce qui éveille la conscience de Banner. Hulk tente de combattre sa présence, mais Thor fait appel aux sentiments de son ami pour la jeune femme et le fait redevenir humain. Bruce se réveille paniqué sans savoir où il est ni depuis combien de temps il n'a plus le contrôle et prend la fuite avec Thor qui essaie d'expliquer en douceur (mais maladroitement) leur situation.
De son côté, le Grand Maître est irrité d'avoir perdu son champion et envoie les responsables (à savoir la Valkyrie et Loki) à sa recherche ainsi qu'à celle de son « ravisseur », en mettant leurs poursuivants en compétition. Une fois qu'ils ont quitté le Grand Maître, le dieu de la Malice découvre l'origine asgardienne de sa rivale et la replonge dans ses pires souvenirs pour prendre l'avantage sur elle. Mais la jeune femme le neutralise puis retrouve Thor, acceptant de l'aider et lui offrant Loki en gage de sa bonne foi. Thor met au point un plan en envoyant la Valkyrie libérer les gladiateurs pour déclencher une révolution tandis que lui et son frère vont s'emparer d'un des vaisseaux du Grand Maître pour fuir par « l'Anus de Satan », le plus gros portail de Sakaar.
Le plan semble se dérouler comme prévu mais Thor, ayant appris à anticiper les coups en traître de Loki, lui colle l'implant qu'il s'est retiré sous couvert d'une tape amicale et l'active lorsque ce dernier tente de mettre son propre plan à exécution. Laissant son frère tétanisé par la décharge délivrée en continu, Thor s'empare d'un vaisseau et part récupérer Banner. Ils sont pris en chasse par des chasseurs de la garde, mais la Valkyrie en élimine une bonne partie, épaulée par Thor. Les deux Asgardiens remontent à bord du vaisseau piloté tant bien que mal par Bruce et s'échappent de Sakaar.
Pendant ce temps, Heimdall organise le sauvetage du peuple asgardien face à Hela qui supprime quiconque s'oppose à sa soif de pouvoir et de conquête. Thor et ses compagnons arrivent à Asgard. Voyant l'état de son royaume, Thor décide d'attirer Héla dans le palais pendant que les autres aident Heimdall et le peuple asgardien à s'enfuir. Alors qu'ils sont presque arrivés à l'entrée du Bifröst, ils découvrent Fenris qui leur barre la route tandis que Skurge et les soldats d'Hela les prennent en tenaille par l'autre côté. Le vaisseau du groupe de Thor arrive alors et attaque les soldats et le loup géant. Voyant la situation dégénérer, Banner décide, malgré le risque de rester de nouveau prisonnier de son propre esprit, de redevenir Hulk et affronte le gigantesque loup avant de tomber du pont avec lui. La Valkyrie, vêtue et armée de sa tenue de guerrière asgardienne, quitte le vaisseau trop endommagé pour continuer à voler et affronte au sol les troupes d'Hela, mais ils sont rapidement dépassés par le nombre jusqu'à ce qu'un gigantesque vaisseau arrive et fasse de gros dégâts dans les rangs ennemis. Le vaisseau fait descendre une passerelle sur le pont et laisse apparaître Loki et les gladiateurs qui descendent en renfort pour permettre au peuple d'embarquer à bord.
L'affrontement fratricide entre la déesse de la Mort et le dieu du Tonnerre tourne en faveur de la première et coûte même son œil droit à Thor. Soudain, la vision de son père lui revient et ce dernier lui explique que le marteau n'était pas la source de son pouvoir mais un catalyseur censé l'aider à le contrôler. Thor laisse alors exploser sa puissance et fait tomber un éclair surpuissant sur Hela, mais en vain. Il décide donc de rejoindre son peuple et de fuir avec lui. Il retrouve avec étonnement son frère puis a une révélation en se remémorant les paroles de son père. Le pouvoir d'Hela puisant sa source dans Asgard même, il demande à Loki de se rendre dans la chambre forte et de placer le casque de Surtur dans l'Éternelle Flamme afin de réaliser la prophétie du Ragnarök qu'il comptait empêcher. Loki s'y rend et s'attarde devant le Tesseract (contenant la pierre de l'Espace, une des six Pierres d'Infinité) avant d'exécuter le rituel : le démon renaît, haut comme une montagne, et commence à détruire le royaume d'Asgard.
La fille d'Odin tente d'empêcher la fuite du vaisseau avec une colonne de pierre utilisée par ses derniers soldats pour se hisser à bord et faire un massacre. Skurge, qui s'était réfugié avec les autres dans le vaisseau et regrettant ses actes, se sacrifie pour détruire la colonne et emporter les soldats avec lui. Hulk réussit à balancer Fenris dans la chute d'eau donnant sur le cosmos et remonte sur le pont puis, voyant Surtur détruire la cité, commence à l'attaquer avant d'être retenu par la Valkyrie et Thor. Ils montent à bord du vaisseau tandis que le Ragnarök consume Asgard, Surtur et Hela.
À bord du vaisseau, Thor découvre que son frère a réussi à quitter Asgard à temps et choisit de rester avec lui. Thor accepte enfin de devenir souverain du peuple asgardien. Il choisit leur prochaine destination : la Terre.
Thor se bat pour restaurer l'ordre à travers l'univers mais une ancienne race menée par le menaçant Malekith revient pour précipiter l'univers dans les ténèbres. Face à un ennemi auquel même Odin et Asgard ne peuvent résister, Thor doit s'embarquer dans son plus périlleux voyage jusqu'à ce jour, au cours duquel il retrouvera Jane Foster et sera contraint de tout sacrifier pour sauver l'humanité.a